Szczególną uwagę zwraca bryła budynku przystani, której dach płynnie przechodzi w elewację pokrytą drewnianymi panelami, a wokół zbudowano tarasy i pomosty. Obiekt z trzech stron otacza woda.
Budynek przystani składa się z dwóch skrzydeł o różnej wysokości. W wyższej części usytuowane są się m.in. recepcja, 22 pokoje hotelowe - jednoosobowe i dwuosobowe, restauracja i biura. W niższym skrzydle znajdują się m.in: sala konferencyjno-szkoleniowa, sala sportowa, siłownia, sauna, gabinet masażu, magazyn łodzi, warsztat naprawczy. Całkowita powierzchnia budynku wynosi ponad 3,3 tys. m kw., a powierzchnia użytkowa - prawie 2 tys. m kw.
Do dyspozycji wodniaków są stanowiska z łączami elektrycznymi, ujęcie wody pitnej i sanitariaty, a także miejsce do zrzutu nieczystości. Na miejscu można wypożyczyć sprzęt turystyczny, m.in. kajaki, łodzie wiosłowe i rowery. Kompleks jest dostosowany do potrzeb osób niepełnosprawnych. Zbudowano pochylnie i zamontowano widny.
Obiekt został zaprojektowany architektów Katarzyną Wojciechowską i Tomasza Rokickiego z ZIVVA Laboratorium Projektowe w Warszawie. Inwestycja kosztowała 19,4 mln zł, z czego wkład miasta wyniósł 12,7 mln zł, a dofinansowanie z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego - 6,7 mln zł.
Zarządcą przystani jest Cywilno-Wojskowy Klub Sportowy Bydgoszczy.
Wyspa Młyńskiej jest urokliwym zakątkiem miasta o powierzchni 6,5 ha. Otaczają ją wody Brdy i jej odnogi Młynówki. Południową i zachodnią pierzeję wyspy stanowi ciąg głównie XIX-wiecznych kamienic nad Młynówką, zwany Wenecją Bydgoską. Od północy roztacza się widok na Operę Nova, położoną na drugim brzegu Brdy.
Władze Bydgoszczy, aby zapobiec degradacji Wyspy Młyńskiej, objęły ją w 2005 r. lokalnym programem rewitalizacji. Ze względu na duże koszty, przedsięwzięcie podzielono na cztery etapy, z których ostatnim była budowa przystani.
W pierwszym etapie m.in. przeprowadzono renowację budynku przy ul. Mennica i zaadaptowano go na Centrum Pracy i Przedsiębiorczości, zajmujące się obsługą przedsiębiorców i osób zainteresowanych samozatrudnieniem. Zbudowano trzy kładki nad Brdą i Młynówką (koszt 12,1 mln zł, w tym 2,8 mln zł w ramach Zintegrowanego Programu Operacyjnego Rozwoju Regionalnego).
Drugi etap objął renowację i adaptację na potrzeby Muzeum Okręgowego im. Leona Wyczółkowskiego pięciu zabytkowych obiektów. W Czerwonym Spichrzu urządzono interaktywne Muzeum Sztuki, w Białym Spichrzu - Muzeum Archeologii, w Domu Młynarza - centrum informacyjno-recepcyjne zespołu muzealnego, w budynku przy ul. Mennica 7 - Dom Leona Wyczółkowskiego z wystawami prac artysty, w domu przy ul. Mennica 4 - Europejskie Centrum Pieniądza (koszt 21,2 mln zł, w tym 11,4 mln zł z Mechanizmu Finansowania Europejskiego Obszaru Gospodarczego).
W trzecim etapie powstała tzw. łąka rekreacyjna, zbudowano amfiteatr, chodniki, ścieżki rowerowe i place zabaw, umocniono brzegi Brdy i Młynówki, zainstalowano oświetlenie (koszt 26,5 mln zł, w tym 16 mln zł z Regionalnego Programu Operacyjnego).
